2005年，教育部领军人才

2009年，入选“新世纪百千万人才工程”国家级人选。

2010年，担任国家973纳米重大科学研究计划项目首席科学家；同年，担任教育部创新团队负责人。

2014年，入选中组部“万人计划”第一批科技创新领军人才。

2015年，入选中国科学院院士增选初步候选人名单。

2016年，入选天津市首批杰出人才。

2016年12月—2019年7月，担任南开大学化学学院院长。

2017年11月，当选为中国科学院院士。

2019年7月，破格提拔为南开大学副校长。

2020年，当选为发展中国家科学院院士。

2023年4月，任天津国际生物医药联合研究院院长（兼）；7月，担任能源催化转化全国重点实验室第一届学术委员会成员。

陈军主要从事新能源材料化学的基础研究和前沿探索，围绕新型电极材料，阐明锂/钠/锌等高比能物质在尖晶石、有机化合物等材料中的储存机制与能量转化规律，拓展了新型电池体系，在无机固体功能材料的合成化学、固体电极制备以及新型电池电极材料开发研究方面做出了重要创新性贡献。提出了“室温—氧化还原—转晶”新合成方法，室温合成出稳定的导电纳米尖晶石，替代贵金属铂电极，应用于可充电金属锂、锌空气电池。提出电极微纳化可改善电子电极反应活性和结构稳定性的设想，经大量实验制备了可逆储氢材料、可充锂、钠、镁电池的微纳多级结构电极，提高了电池的安全性，为降低电池电极材料成本及解决电池燃烧爆炸提供了新思路。

据2024年4月南开大学化学学院官网，陈军在Nature、Nature Chem.、eScience等期刊发表学术论文600余篇，他引超过10万次，为科睿唯安和爱思唯尔高被引科学家。

陈军为本科生和研究生主讲《材料物理与化学》《能源化学》《当代化学前沿》《化学电源》等核心课程，指导《综合化学实验》专业实验课。

陈军在教学观念上，以学生为本；在教育内容上，从侧重“传授知识”转变为重在“提升素质”；在培养模式上，从“以教为主”转变为“以学为主、教学相长”。他注重教学改革与启发式教学，增强学生互动，引导学生自主学习和独立思考，在实践中不断丰富和发展学生主动学习的特色教育理念、模式和方法，培养学生主动创新教育，推动教育教学改革。

截至2018年7月，陈军为魅力化学、绿色化学、能源化学等科普夏令营指导本科生500余人，培养研究生97人（其中为中西部培养29人）。学生13人次获国家万人计划科技创新领军人才、中国青少年科技创新奖、国家优秀青年科学基金、教育部新世纪优秀人才、全国优秀博士论文提名等荣誉。

陈军以第一作者编著《新能源科学与工程导论》、《能源化学》和《化学电源——原理、技术与应用》，主讲《化学与能源》作为核心教材与课程，入选国家教学团队、国家实验教学示范中心、教育部精品视频公开课，获国家教学成果一等奖（2009年，第八完成人）、宝钢优秀教师特等奖提名奖（2013年）。主持的“新能源科学与工程专业创新创业人才培养体系研究”入选教育部2018年公布的首批“新工科”研究与实践项目。

陈军院士着力构建绿色低碳的新能源体系，投身实现“双碳”目标的主战场，攻坚克难，开拓创新，砥砺深耕新能源材料与电化学储能领域，聚焦高密度储氢材料、高性能锂/钠电池、高安全水系电池的基础研究，实现“从0到1”的原创性技术突破。坚持科教融合，产教融合，搭建新型化学电源产学研用链式创新平台，瞄准绿色能源和先进制造等前沿领域，促进“从1到N”的科技成果转化，争做勇攀科研高峰的“排头兵”，长期服务电化学领域，立德树人，言传身教，培养了一批勇担重任的栋梁之材。（2023年“储能杰出贡献奖”颁奖词）